Vil du så ikke være venlig at forklare mig sammenhængen, jeg er nok lidt tungnem?

Mig bekendt fastsætter Banedanmark afgifterne jf. bemyndigelse i lovgivningen.

Ja, i følge lovgivningen.

Hvem ejer Banedanmark? Staten.

Hvem sender en regning til for brug af Storebæltforbindelsen til Banedanmark? Storebæltforbindelsen.

Hvem ejer Storebæltforbindelsen? Staten.
Hvem styrer staten? Folketinget og regeringen.

Kommer sådanne detajlspørgsmål som Storebæltforbindelsen takster op politisk?
Ja, i dette tilfælde gør de. Det er et meget vigtigt spørgsmål for den jyske mafia.
Men normalt går man ikke så meget i detaljer.

Bestemmer Banedanmark taksterne efter forgodtbefindende?
Det kan jeg ikke forestille mig, de ser på udgifterne.
Se hvad der står øverst i bekendtgørelsen, som du refererer til "efter bemyndigelse fra transportministeren".
Se også jernbanelovens §11 stk. 1: "Transportministeren fastsætter regler for de afgifter, som jernbanevirksomheder skal betale til Banedanmark for at benytte jernbaneinfrastruktur, samt en kompensationsordning med henblik på konkurrencemæssig ligestilling af jernbanegodstransport med andre former for godstransport.

Så det er regeringens ansvar under under folketingets kontrol.

/Lars